Biobanksprov från PPMC Lungcancer ger möjlighet att studera effekterna av immunterapi

– PPMC Lungcancer är en unik källa för forskning eftersom insamlingen av prover startar tidigt i vårdförloppet och samlingen innehåller en stor mängd kliniska data, säger Sukanya Raghavan, docent i immunologi vid Sahlgrenska akademin och biolog vid Sahlgrenska Universitetssjukhuset.

Rutin för uttag finns på plats

Caroline Olsson och Andreas Hallqvist, projektansvariga för PPMC Lungcancer, berättar hur det går till när forskare vill använda insamlade prover.

- Vi har skapat en rutin för uttag där intresserade forskare kontaktar oss och förklarar vad deras projekt undersöker. Sedan diskuterar vi tillsammans om PPMC Lungcancer har den typ och mängd prov som de söker. Vi säkerställer också såklart, i ett tidigt skede att, alla tillstånd som behövs för att genomföra studien finns på plats. I samråd med Biobank Väst gör vi sedan en uttagsbeställning enligt deras befintliga rutiner och därefter tar den ansvariga forskaren vid för att genomföra de överenskomna analyserna.

Ökad kunskap om effekterna av immunterapi

- Immunterapi är ett sätt att få kroppens immunförsvar att angripa cancerceller. Utvecklingen av immunterapi har lett till ökad överlevnad och fler möjliga sätt att behandla patienter med lungcancer. Trots det är det i dagsläget enbart 20–40% av patienterna som svarar på behandlingen, berättar Anna Rohlin, Ph. D och översjukhusgenetiker vid Sahlgrenska Universitetssjukhuset.

Två studier försöker nu hitta förklaringar till varför det är så att vissa patienter blir hjälpta av immunterapi och andra inte.

- I vår forskning har vi använt serum i blodet från 156 patienter i PPMC Lungcancer samt från friska personer för att titta närmare på nivåer av 90 olika proteiner. Resultaten visar att det finns tydliga nivåskillnader i visa proteiner, hos lungcancerpatienterna och de som är friska. Vi har även funnit att hos patienter med lungcancer är nivåerna av proteinerna kopplade till rökning och stadie i sjukdomen, säger Sukanya.

Fynden kring proteinerna är oerhört värdefulla för Sukanya och hennes forskargrupp vars mål är att hitta biomarkörer för lungcancer.

- I framtiden hoppas jag att vi i ett enkelt blodprov vet vilka biomarkörer vi ska leta efter för att upptäcka lungcancer. Kunskapen skulle ge oss möjlighet att tidigt upptäcka lungcancer, få kunskap om hur långt i sin sjukdom som patienten är samt om och hur behandlingen fungerar, berättar Sukanya.

Anna Rohlins forskning handlar om att hitta genetiska markörer i DNA som kan hjälpa till att förutsäga vilka patienter som har störst chans att svara på immunterapi. Genom att analysera både blodprov och tumörvävnad vill forskargruppen förstå hur förändringar i patienters DNA påverkar behandlingsresultatet.  

För att kartlägga genetiska markörer i tumörvävnad används DNA-tekniken Next Generation Sequencing (NGS). Målet för forskargruppen är att hitta förändringar i DNA som kan fungera som vägvisare för hos vilka patienter som immunterapi har effekt. Förhoppningen är också att förändringarna kan användas för att skräddarsy specifika tester i blod som kan spåra tumörens utveckling över tid.   

Blodproverna analyseras för att hitta cirkulerande tumör DNA (ctDNA), vilket är små mängder av tumören som läcker ut i blodet.

- Genom att följa ctDNA vid olika tidpunkter under en behandling hoppas vi tidigt kunna se om den fungerar eller inte. Vi vill bidra till att fler patienter får rätt behandling i rätt tid och att de patienter som inte svara på immunterapi kan få andra behandlingar som är mer effektiva för dem, säger Anna.

- Vi har fått mycket spännande resultat i studien där vi följt ctDNA i blodet. Det visar sig att metoden för att analysera ctDNA ger samma resultat som när vi bedömer röntgenbilder om hur tumören växer. Analyser av ctDNA är dessutom möjliga att göra flera veckor innan tumören syns på röntgen, berättar Anna. 

Ett väl fungerande samarbete

- Vårt samarbete med PPMC Lungcancer och Biobank Väst har fungerat utmärkt. Jag och Caroline Olsson på PPMC Lungcancer diskuterade forskningsprojektet och gick igenom de ansökningar om etikprövning och biobankning som behövde finnas på plats. Därefter hjälpte Biobank Väst till att förbereda proverna i rätt format för analysen, en insats jag är mycket tacksam för, berättar Sukanya.

Anna berättar att det har varit smidigt att få ut biobanksprov och värdesätter det stöd som funnits under hela processen. Projektet har snabbt kunnat få svar på olika frågor som uppstått längs vägen.

- Vi vill gärna göra fler studier med hjälp av biobanksprov och data från PPMC Lungcancer. I kommande projekt vill vi bland annat titta på förekomsten av genetiska biomarkörer i andra stadier av sjukdomen och hos vissa grupper av patienter, exempelvis icke rökare, som vi tidigare inte studerat.